mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCCAA CGTGTTCACAGCGGACCTTGAT GGGTTTTGCTCGTGCGTTCTTTTTGAGTTCTCGCTCTGCGTGTTCACAGCGGACCTTGATTTAATGTCCATACAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAGAAGAATCTCTCCAGCAACGAGTTTGCGC 4 1 3' arm Danio_rerio mirbase mir-124 2e-27 gga-mir-124a-2 2e-33 -43.42 ..((...((((((((.........(((((((..(((((.((((((((.(((..((((((((............))))))))..))).))))))))).)))).)))).)))....)).))))))..)).. (-43.42)