mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAGATTCACGCACAAACTTG GGTTCGTGCGTGAATCTAATC GGTGTGAGAGACAGAGGCAAATCGCAGGTTCGTGCGTGAATCTAATCAAAGTTTCTCATTAACTTCTGCGTTAGATTCACGCACAAACTTGTCATTTCCCTTTTCTTAACCTTTTTTTTT GGTGTGAGAGACAGAGGCAAATCGCAGGTTCGTGCGTGAATCTAATCAAAGTTTCTCATTAACTTCTGCGTTAGATTCACGCACAAACTTGTCATTTCCCTTTTCTTAACCTTTTTTTTTTCCTTTTCCGTCAAAACTTTGTTTGTTACATTCGACTTCGAATTCAGATTCAGATTTCTCTGTTTAGTGCTCCTCAAACCGATGACGCCGCGGCTTGTTAGCTTCTGGCTCCGCTACGGTATGGCATCTTCCATATTGCACCCATTTTGTTCTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTTCCCTAAATTTTCCATGTCAATATTATGTAATTCTGTAAGGAGATTTTTTTAAATGTAAAGCCATGCCTCCATAGCTATTTTTTTTATTGGAGGTAATTCGTTCGAACTGGACTATTATGAGTGACAAACAAAACTTTTTCTCTAAATATGCAATGCAATTCTACTCCAATATGAAATCTTTGATTAAACTGCAACAATATTACCATCGCACTTGATGGCATTCAGT 1 0 3' arm Glycine_max mirnest MIR403 0.0004 vvi-MIR403a 0.00002 -43.1 (((.(((((((...(((.((((.(((((((.((((((((((((((((((((((.......))))).)).))))))))))))))).))))))).)))).)))))))))))))......... (-43.1)