mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTGAGACCCTAACTTGTGA CACGGGTTGGGTTCTCGGGAGC GTGCCCCTCTCCTTCCCTGAGACCCTAACTTGTGACGTTCTGCTTCGATGTCCACGGGTTGGGTTCTCGGGAGCTGTGAGAGGCAC 1 2 5' arm Danio_rerio mirbase lin-4 2e-33 fru-mir-125b 8e-20 -43.4 (((((.(((.(.(((((.((((.((((((((((((((((.......))))).))))))))))).)))))))))..).))).))))) (-43.40)