mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGTACCGTGAGTAATAATGC ATTATTACTTTTGGTACGCGC GAGCCATTTTAACTGCTTCACAGTCCATTATTACTTTTGGTACGCGCTAGGCCAGACTCAAACTCGTACCGTGAGTAATAATGCACTGTGGCAGTGGGTTT 3 0 3' arm Danio_rerio mirbase mir-126 5e-28 dre-mir-126b 9e-17 -41.4 (((((......(((((..((((((.(((((((((((.(((((((.(..((......))....).))))))).))))))))))).))))))))))).))))) (-41.40)