mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGTACCGTGAGTAATAGTGCA CATTATTACTTTTGGTACGCGC GAGTCTTACCGGCCTCACGGTTCATTATTACTTTTGGTACGCGCTATGCCACTCTCAACTCGTACCGTGAGTAATAGTGCACTGTGACTGGTGAACACAACTA 3 0 3' arm Danio_rerio mirbase mir-126 3e-26 fru-mir-126 2e-24 -40.06 ..((.(((((((..(((((((.(((((((((((.(((((((.(...............).))))))).))))))))))).))))))))))))))))....... (-40.06)