mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTTTTGCGGTCTGGGCTTGCT GAAGCCCTTACCCCAAAAAGTA GTCCTTTTCAGGTCTTTTTGCGGTCTGGGCTTGCTGTTCCTTGAACCAGTAGCCAGGAAGCCCTTACCCCAAAAAGTATCTGCAGAGGAC 4 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-129 8e-45 mdo-mir-129 2e-26 -41.6 (((((((.((((((((((((.(((..((((((.(((((.((......)).)).))).))))))..))).))))))).))))).))))))) (-41.60)