mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTTTTGCGGTCTGGGCTTGCT GAAGCCCTTACCCCAAAAAGCA GTCTTTCACGAATCTTTTTGCGGTCTGGGCTTGCTGTTCTCAACTATCAATGGGAAGCCCTTACCCCAAAAAGCATTTGCGGAGGGC 4 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-129 5e-43 fru-mir-129-1 2e-23 -36.8 (((((((.((((((((((((.(((..((((((.(((((..........))))).))))))..))).))))))).))))).))))))) (-36.80)