mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGTGCAATATTAAAAGGGCAT GCCCTTTTTCTGTTGTACTACT GGGAGAGGTCTGTACGGTGATATTGACCATGTTTTGTCCATTGCCCTTTTTCTGTTGTACTACTGGCCAATCAGAAGAGCAGTGCAATATTAAAAGGGCATTGGCTGATAGAACAGAGTCCTTCACCTCTCACCCTCTCCT 4 0 3' arm Danio_rerio mirbase mir-130 5e-38 dre-mir-130c-2 5e-22 -59.62 ((((((((..((...(((((....(((..(((((((((((.(((((((((..(((((((((.((.............)).)))))))))..))))))))).)))...))))))))..)))..)))))...)).)))))))) (-59.62)