mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGTCCCCTTCAACCAGCTA GCTGGTCAAATGGAACCAAGTC CACGCCTTGCTGTGGCTGGTCAAATGGAACCAAGTCAGGTGTTTCTGCGAGGTTTGGTCCCCTTCAACCAGCTACTGCGTCGTG 5 0 3' arm Danio_rerio mirbase mir-133 6e-33 dre-mir-133c 0.000000000000004 -34.3 ((((...(((.(((((((((..((.((.(((((..(..((......))..)..))))).)).))..))))))))).))).)))) (-34.30)