mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGTCCCTTTCAACCAGCTA GCTGGTAAAACGGAACCAAGTC GAAACACGGCTTAGTTGCTGGTAAAACGGAACCAAGTCGGGTGTTTGCGAGAGGTTTGGTCCCTTTCAACCAGCTACTGCGCCGTGAATTC 6 0 3' arm Danio_rerio mirbase mir-133 8e-42 dre-mir-133b 0.000000000000005 -39 ....((((((.((((.((((((..((.((.(((((..(...((....))...)..))))).)).))..)))))).)))).))))))..... (-39.00)