mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTATTGCTTAAGAATACGCGTA CGGGTATTCTTGGGTGGATAATA GTTCTGTTGTTTCCCTCTATAAAGGACTCTCTTCGGTGACGGGTATTCTTGGGTGGATAATACGGCTCTCGTTGTTATTGCTTAAGAATACGCGTAGTCGAGGAGAGTCATGTCGGCGGCGAGAGAGC 4 1 3' arm Danio_rerio mirbase mir-137 1e-50 dre-mir-137-1 2e-39 -58.2 (((((.((((..((..(.......((((((((((((..(((.(((((((((((..(.(((((((.....)).))))))..))))))))))).)))..))))))))))))..)..))..)))).))))) (-58.20)