mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCTGGTGTTGTGAATCAGGCC CTATTTCACAACACCAGGGTG TGTGTGCTGCAGCTGGTGTTGTGAATCAGGCCGATGTCACACGTCAGCGATAACCCGGCTATTTCACAACACCAGGGTGGCACCACA 4 1 5' arm Danio_rerio mirbase mir-138 7e-39 fru-mir-138 2e-20 -44.2 .((((((..(..(((((((((((((...(((((.((((.(......).))))...)))))..))))))))))))).)..))).))). (-44.20)