mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGTGGTTTTACCCTATGGTAG ACCACAGGGTAGAACCACGGAC GTGTTTGTCTCCTGTGTCCCGTCAGTGGTTTTACCCTATGGTAGGTTACGTCATGCTGTTCTACCACAGGGTAGAACCACGGACGGGATGTCTGGAGGTGTCTGC 2 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-140 2e-33 gga-mir-140 2e-33 -56.7 (((..(..((((.(..(((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))).)))))))..)..))))..)..))) (-56.70)