mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTATAGCATCATGAGCAATCA ACTGCTCATGATGTTATATCA CTAGCACACATTTTATTCAGGAATAATGAAGTATAGCATCATGAGCAATCAGCCTTAGATTTTTTTAGCAGATTGACTGCTCATGATGTTATATCATTTCCATGAATTTACCTCTATGCATGC TTTTTTTTTTTTTTTGGGCATAATGGTAATCAGTTCAATTAATGCTGCTAAAAAAGTAGCATTCAAATGATTAATCACACAAATGTGCATATACATCGAAATATAGCGCATTAATTAGTACCATCATCTTAATTAATTAAGCTAAATGAGAATAAAGAAAACTAATTAAGCTTGATTTCCATGAATTATGAAGTCTTCAAGGGCTTGCAAATACTGTCACGGCTAGCTAGCACACATTTTATTCAGGAATAATGAAGTATAGCATCATGAGCAATCAGCCTTAGATTTTTTTAGCAGATTGACTGCTCATGATGTTATATCATTTCCATGAATTTACCTCTATGCATGCTACCATATTTATATGTATATGCTGCCCCATTTGTAAAAAACTCCTAACGAAAGCCCCCTCCTAGGGCTGGAGCCCAATAATCTGCTCCATTGTCACTTCCAACTTGCAGTGTGCATGACACTGGCACCAGACACAACCCTCTACTCCTCAGCCCCTTCTTTGGTTCTTCTTGAGTATCCGGCTCTCCAGCTGCTTTCCTCTTCAAGCAGTTTTCATCCAGCAGCTGACCGGGGTCTTCAGGGAATATACATCTCTTCTCTCCTTGAACAGAATGTTGCTGCCTCGTGTTCCCTGATCCACCGCTCAAGTATGGTAAGCTAAGAGCCTCAATTTG 2 0 5' arm Glycine_max mirnest 100 100 -36.2 ...(((........(((((((((..((((..((((((((((((((((.((((.((((((....))))..)).)))).)))))))))))))))))))))))).))))).........))).... (-36.2)