mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATAAAGTAGACAGCACTACTA GTAGTGTTTCCTACTTTATGGA ACAGTGCAGTCACTCATAAAGTAGACAGCACTACTAAACTTCTCTACACAGTGTAGTGTTTCCTACTTTATGGATGAGTGTACTGT 4 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-142 2e-42 fru-mir-142b 2e-29 -39.57 ((((((((.(((..((((((((((..((((((((..................))))))))..))))))))))..))).)))))))) (-39.57)