mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGATGAAGCACTGTAGCTC GGTGCAGTGCTGCATCTCTGG GATCTACAGTCGTCTGGCCCGCGGTGCAGTGCTGCATCTCTGGTCAACTGGGAGTCTGAGATGAAGCACTGTAGCTCGGGAGGACAACACTGTCAGCTC 4 0 3' arm Danio_rerio mirbase mir-143 4e-50 dre-mir-143-1 2e-51 -45.2 ((.(((((((.((((..((((.(.(((((((((.((((((.((((......)).)).)))))).))))))))).).)))).))))...))))).)).)) (-45.20)