mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCATAGTCACAAAAATGATC CATTTTTGTGATTTGCAGCT GATGGAGATCAGTAGGTCCCTGGACGTAGCACACCTCCCAGTGTCATTTTTGTGATTTGCAGCTAGTAGTCTGGGTCCAGTTGCATAGTCACAAAAATGATCATTGGTAGGTGTGAGTGCAGCAGGAGTGAGGCTTACCGGATCCTCCATC 1 1 3' arm Danio_rerio mirbase mir-153 3e-27 fru-mir-153b 4e-29 -71.8 ((((((((((.(((((((((((...(((.(((((((.(((((((((((((((((((((((((((.(..........).))))))).)))))))))))))).)))))).)))))))..)))..)))).....)))))))..))).))))))) (-71.80)