mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGTGTCTTGTGTTGCAGCC CTGCAACACAGGACATGGGA TGACCTGTGGCTGGGCCAGGGGCTGCAACACAGGACATGGGAGCTGTCTCTCACTCCCGCTCGTGTCTTGTGTTGCAGCCAGTGGAACG 2 0 3' arm Danio_rerio mirbase mir-187 3e-44 fru-mir-187 5e-18 -48.8 ............(..(((..(((((((((((((((((((((((.((.....)))))))....))))))))))))))))))..)))..). (-48.80)