mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATATGTTTGATATATTAGGT TATATATCAAACATATTCCT TCTGGAGGTGAGGTAGACCTGGAAGCCTTTCTGCAGGCCTCTGTTTGATATGTTTGATATATTAGGTTGTTATTCTGTCCAACTATATATCAAACATATTCCTACAGTGTCCTGCTCTGTCTCCAG 1 2 5' arm Danio_rerio mirbase mir-190 4e-29 mdo-mir-190a 9e-33 -46.8 .(((((((.(((((..........)))))...(((((.(.((((..((((((((((((((((..(((((..........)))))))))))))))))))))...)))).).)))))....))))))) (-46.80)