mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACTGGCCTACAAAGTCCCAGT TGGGTCTTTGCGGGCAAGGTGA GACATTAATGTGTTAGAGGTTGGGTCTTTGCGGGCAAGGTGAGTAGTTAAATTTACTCTCAACTGGCCTACAAAGTCCCAGTTTCTGGCTCATGTTATC 6 0 3' arm Danio_rerio mirbase mir-193 4e-50 fru-mir-193 0.0000000003 -42.2 .......(((.((((((..(((((.(((((..(((.((.((((.(((.......))))))).)).)))..))))).)))))..)))))).)))...... (-42.20)