mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACTGGCCTACAAAGTCCCAGT TGGGTCTTTGCGGGCAAGGTGA GAAAGTGTGTCAGAGGCTGGGTCTTTGCGGGCAAGGTGAGTTTTCCTTTTATTCAACTGGCCTACAAAGTCCCAGTTTTCGGCCCATGTGACCATCTC 5 0 3' arm Danio_rerio mirbase mir-193 2e-48 dre-mir-193a-3 8e-51 -38.1 ....(((.(((..((((((((.(((((..(((.((.(((((.........))))).)).)))..))))).))))))))..))).)))........... (-38.10)