mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCAGTGTTCAGACTACCTGTTC ACAGTAGTCTGCACATTGGTTA GGAGTTTTTGTGGACGCCCGTCCCGCCTGCCCAGTGTTCAGACTACCTGTTCAGGAATTAGTGTTTGTACAGTAGTCTGCACATTGGTTAGGCTGG 3 1 5' arm Danio_rerio mirbase mir-199 2e-42 fru-mir-199-2 4e-31 -39.7 ((.((((....))))..))..((.(((((.(((((((.((((((((.(((.((((........)))).))))))))))).))))))).))))).)) (-39.70)