mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCATTTTTAAAATAGGCATT TGCCTATTTTAAAATGAAAA CCTTGTCCTCTTCACTTGAAATCAAATTCAAGACCGCCTTGCCTTCCTTCTCAGTACATTCCATTTCGAATGGAAGCAGGGCTTTGCTATTTTCATTTTTAAAATAGGCATTGGGGTCCCTTCTTGTTCCTCCTTTTCCTTTCCTATCCCAATGCCTATTTTAAAATGAAAACAACGATACACTGTTTTCGTTTGAAACTATTGTTAAGGAAGATAACGCTGACGAGTTCTTCAATTTGATTTTAGCTGACGGGGACCTT GGAAAGTTAGATCTGAAAGACAAGAGTTTTAGGTTTGTGGGAGAAGAAGAAGAAGATGAAGAAGAAGATGAAGAAGAAGATGAAGAAGAAGATGAGGCGCCCTTGTCCTCTTCACTTGAAATCAAATTCAAGACCGCCTTGCCTTCCTTCTCAGTACATTCCATTTCGAATGGAAGCAGGGCTTTGCTATTTTCATTTTTAAAATAGGCATTGGGGTCCCTTCTTGTTCCTCCTTTTCCTTTCCTATCCCAATGCCTATTTTAAAATGAAAACAACGATACACTGTTTTCGTTTGAAACTATTGTTAAGGAAGATAACGCTGACGAGTTCTTCAATTTGATTTTAGCTGACGGGGACCTTTTTTTATTCATCCACAGTCTCTGACTCTATTACGGCTAAACAAGGTTTTCTCCATTCACTCCTAATTTTATGGGCTACTCATTTAATTTGTGTGTGTATGTTATAGTGATGCACAGTGTCAATTGATTTTCTCTGATGGACTTTTTGCCCAAGGGAAAGGTGGGGA 0 1 5' arm Glycine_max mirnest 100 gma-MIR1514a 6e-51 -81.1 ....((((((.(((.(((((((((((((.((((..((.(((.(((((((..(((((.......((((((((((((((((....(((...((((((((((.(((((((((((((((((............................)))))))))))))))))))))))))))...)))....)))))))))))))))).)))))..))))))).))).))........)))).))))))))))))).))).))))))... (-81.1)