mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGGCAGCGGTTCATCGAT CGATAAACCTCTGCATCCAGC AATTTTAATTTTGGAGGTGTATCGAGATGAGGTGAAGTCACTGGAGGCAGCGGTTCATCGATCTCTTCCTGAATTTGGTTGTGGAAGAACACAAAGCAAGAATCGGTCGATAAACCTCTGCATCCAGCGCTCACTTTGCCTCTCTTTACCAGCAATTTCCTTTCTC GGGGGCCTTTGAAAAGTCACTGTGGTGGATCCGTGACTCAAAACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGATACACACACTTGCGGCAATGGTGACTCCACAGATTCCTGGTTCATATTACATATATTCCTCTTTCTCTCTCTCTTCCCTGTGTGTCATATTGTTTTCTTTTCTTTAATACTATTTATTGCTTAGCTTCCTATTACTCATATTTCCCCCCGGTGTGTGTGTGTATGTGTGACTTGTGATGGAAGAGAAATTGGCTCTAATTTTCTCTTTATGTTCAGATCTATGTTTTTCACATCACGGATCGTATTTGCTGTTTTTAGCTACCGTCTTTGCGTGTCCAATATCTCATCCAAAAACACACAAAAAAATTACAAAGCTGTGTTTGTTGTTTTGATTTTTGTTATTTCACGGATAATTTTAATTTTGGAGGTGTATCGAGATGAGGTGAAGTCACTGGAGGCAGCGGTTCATCGATCTCTTCCTGAATTTGGTTGTGGAAGAACACAAAGCAAGAATCGGTCGATAAACCTCTGCATCCAGCGCTCACTTTGCCTCTCTTTACCAGCAATTTCCTTTCTCTTTCTTCTCTTAAATAACATTGTTTTTATGCTTCCTCTTGTTTTCATATGGAAAAATTAGTTAGCGTTCACGAATTCTCTGTATCAGCATTTCTATGAAAGATTTTTCTTCTTCGTAGCGAGTACTCAAATCTAGATGCCTCTGCTGTTATTTGAAATAATTTTATATTACTTCGTTTGCGCTTTCTTCCGAGATAATGCCTGTAGTGTTGCAGCTGCTAATTTTCTGATTTGTGGTGATTTTGCTATGAGATGAGGGAAAAATAAATAAATATAATATCGGCTGTTGTATTAAACAGAATGCGTTATTGTTTATTGCTGCTAAATTTTGAGGAATATTCTGTTAATTT 3 0 5' arm Glycine_max mirnest MIR162_2 3e-18 vvi-MIR162 7e-25 -50.4 ............((((.(((...((((.((((((((((..(((((.((((.((((.(((((((..(((.((.......(((((......)))))..)).)))..))))))).)))).)))).))))).....)))))))))))))).....)))..))))...... (-50.4)