mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATGCCCCTAAAAATCCTTAT GAGGGGCTTTTGGGGGCACTTGTG CCGCAGGGAGAATGAGGGGCTTTTGGGGGCACTTGTGTTTCAGTTTCACCATCATAATGCCCCTAAAAATCCTTATTGCTCTTGCACTG 1 2 3' arm Danio_rerio mirbase mir-365 3e-44 cfa-mir-365-1 1e-24 -37.26 ..((((((..((((((((..(((((((((((.(((((...............)))))))))))))))).))))))))..)))))).... (-37.26)