mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCCAAGGATGACTTGCCTGT AGGCAGTCTCCTTAGCTAA TGTCGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTTTCTTCTTTACCAAGGGTACTTGGTGTTCTTAAAGACCTTGTTTGGTTGGTTATCAGGCAGTCTCCTTAGCTAACCTCACAA ATTTAGTTGTCACTGGGAACTGAGTGAGTGAAATGCATGTTGGTAGTACAACTTTACAAGGGAGGTCTTGCATGAAATGAAGAGTGTCGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTTTCTTCTTTACCAAGGGTACTTGGTGTTCTTAAAGACCTTGTTTGGTTGGTTATCAGGCAGTCTCCTTAGCTAACCTCACAATCTCTTCACTCTCATGTTAGATCTTTTCTTGTTTGATTAATTATCTCAATATTGTGACAATAAACCGATTTAGATTATGTTATCCTTTCCTACACAGAGTTTTGTTATCGTATGCTAAATTGAAAACTTTTGAAGGTCGAAATTAAAAAAAAAATAGTAAAAAGGATTTTGTCTTGATGGAATGGATTGGAAATATCTTTCAAACGAAAGAAGGTATACATTGCAATGGATTGTCACAGTGGTGATACTATTATACTTTTGTGTATATATTGATAAAATTATGTAAGGGCGAATGGTTGATGTTCCAGATTTTGTCTAAATTGTAATGCATATGTAAGTGTAGTGTACGAGTATATATATACGGTGGATGCAAACACCAAATTTGGTTTAAAAAAAAAAAACTTAAAAAAA 2 2 5' arm Cichorium_intybus mirnest MIR169_5 0.0000000004 ath-MIR169m 0.00000000002 -36.2 ....((..((((((.(((((.((((.(((((.....((...(((((((((.(((..........)))))))...))))).))....)))))))))))))).))).)))..)).. (-36.2)