mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTCCCAATTCCGCCCATTC ATGGGCTGATTGGGAAGCAA GTGAATACGAAGAGCTGGGAACGGGAGATTGGAGCAATCAGAATTTGTGGGAATGGGCTGATTGGGAAGCAATGTGTGCTGGTGCAATGCATTTAATTTCTTCCCAATTCCGCCCATTCCTATGATTTCTGATGATTCTTTCCTTTCCTTTTGCTTTTTGCAATACGC TCATTCAATTCACAGAGTGAATACGAAGAGCTGGGAACGGGAGATTGGAGCAATCAGAATTTGTGGGAATGGGCTGATTGGGAAGCAATGTGTGCTGGTGCAATGCATTTAATTTCTTCCCAATTCCGCCCATTCCTATGATTTCTGATGATTCTTTCCTTTCCTTTTGCTTTTTGCAATACGCAATATGCATGTACCTTATTTTTCATTCCATCCTCATTATTCTATGCTAATGGATAGTACTTCCTTCTTCA 2 1 3' arm Glycine_max mirnest 100 pvu-MIR482 7e-65 -68.9 (((....((((((((.(((((.(((((...((((..(((((((.((((((((((((((.((((((((((.(((..((((.........))))...))).))))))))))..)))))))))))))).)))))))..))))))))))))))...))))))))...))).. (-68.9)