mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATTGAGCCGCGTCAATATC TATTGGCGTGCCTCAATTTGA AGGTGGTGATGGGGGAAGTGTTGTATGAAGCACAAATCAAGGTATTGGCGTGCCTCAATTTGAAGACATGGTTAAGATGAAAACCAGCCATGTAATTTTAATTGAGCCGCGTCAATATCTCATCTTGCACTTCTTTCCATCTTCATCCCAATCTCAAA ATTAAGAAAAGAAAATTAAGAGTGGTGAAAAGTGGCATAATCAGCATCTGGGGCACACATGGAGAAAGGAGAAGAATCAAAATCCATAAGGGTCATAGGTGGTGATGGGGGAAGTGTTGTATGAAGCACAAATCAAGGTATTGGCGTGCCTCAATTTGAAGACATGGTTAAGATGAAAACCAGCCATGTAATTTTAATTGAGCCGCGTCAATATCTCATCTTGCACTTCTTTCCATCTTCATCCCAATCTCAAATCCTCCCTGGTATGTTCATGTTAATTATTTCTCCAATCCTCATTAATTTTTTTTTCCTCTCTCTCTTAATTATACAGTTGTCCTTAATTAATTTCCCGAGTTATATAATGTATTTCTTTTCAAACATATACATATCT 2 0 3' arm Glycine_max mirnest MIR171_1 0.000000002 vvi-MIR171b 0.0000000001 -52.2 .(((((.((((((((((((((...((((............((((((((((((.(((((((.(((.((((((((............))))))))..))).))))))).))))))))))))))))...))))))).))))))).)))))........... (-52.2)