mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTTGTTTTACCTATTCCACC AGGGATAGGTAAAACAATGAC TGTTGGATTTTATGGAACTGGAGGGATAGGTAAAACAATGACCGCTGTATAAGTAATTGTTATAGTTAGTTGTTGTTTTACCTATTCCACCCATTCCATGTATCCCTTT GGTTGCTCTTTGTTTTCATTGTTGACTAAGTAGTTGTGAATCTTTTGCCCTTAACCATATGAAGGTGTTAACTCGTTCTCTATGTTGGATTTTATGGAACTGGAGGGATAGGTAAAACAATGACCGCTGTATAAGTAATTGTTATAGTTAGTTGTTGTTTTACCTATTCCACCCATTCCATGTATCCCTTTCCTGAGGGCGCGGTTAATTTCTTACTTTTCACTGCCGATTCCGTTGAAGCTTTGGGTTTTAATCAGACGAATGAAAGTATATTAAGTTTTTGCTCTGGATTTATGTGCCTGTAAAATGATCTTAAGATTCTAACTTTATTATTTGTTTATGGGATTTTTTTTCTTTTTTGGCCAATA 1 0 3' arm Glycine_max mirnest 100 gso-MIR1510a 4e-50 -43.6 ....((((..(((((((..((.((((((((((((((((((((.(((((((((....))).))))))..)))))))))))))))))))).))..))))))).)))).... (-43.6)