mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGTGCCCTTGGACTACATCG ATGCAGTCCATGGGCATATACA TCCCTGGTGTGAGGGTATGTGCCCTTGGACTACATCGTGGAAGCCAGCACCATGCAGTCCATGGGCATATACACTTGCCTCAAGGCCTAGATCTTC 3 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-455 1e-37 gga-mir-455 5e-43 -42.4 ...(((((.(((((((((((((((.((((((.(((.(((........))).))).)))))).)))))))))).....)))))..))).))...... (-42.40)