mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTATGTGCCCTTGGACTACATT TGCAGTCCATGGGCATATACAC ATCGTTGTTCCCTGAAGTGAGGGTATGTGCCCTTGGACTACATTGTGGAGGCCAGCACCATGCAGTCCATGGGCATATACACTTACTTCATGGCCTACATCAACA 3 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-455 2e-27 tni-mir-455 7e-30 -50.1 ...((((..((.(((((((((.((((((((((.((((((.(((.(((........))).))).)))))).)))))))))).))))))))).)).......)))). (-50.10)