mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGGCTGGTTAGATGGTTGTCA TGCAGGCATCTTTCCAGTCTACATGTG GCTGGTTGTGTGTGCAGGCATCTTTCCAGTCTACATGTGGATCCAGGAGTCTGCAGGCTGGTTAGATGGTTGTCACGTACCCAGC 3 5 3' arm Danio_rerio mirbase mir-456 7e-42 pma-mir-456 0.0000000000003 -39 (((((.((((((.((((.(((((..(((((((....(..(((......)))..))))))))..))))).)))))))))).))))) (-39.00)