mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTCCATATCTGGGGAGCTTC AGCTGCTTAGCTATGGATCCC TGAGGATCTTACTGGGTGAATTGAGCTGCTTAGCTATGGATCCCACAGTTCTACCCATCAATAAGTGCTTTTGTGGTAGTCTTGTGGCTTCCATATCTGGGGAGCTTCATTTGCCTTTATAGTATTAA TTCTAGCTAGCTAGGGTTTGGGTAGTGAGTGTAATAAAGTTGCAAAGTTTTTGGTTAGGTTACGTTTTGACCTTATTATTATAGTTCAAAGGGAAACATTAATTAAAGGGGATTATGAAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAATTGAGGATCTTACTGGGTGAATTGAGCTGCTTAGCTATGGATCCCACAGTTCTACCCATCAATAAGTGCTTTTGTGGTAGTCTTGTGGCTTCCATATCTGGGGAGCTTCATTTGCCTTTATAGTATTAACCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACCCTTCTCTTCTTTTCTCTCATAATAATTTAAATTTGTTATAGACTCTAAACTTTAAATGTTTTTTTTGAAGTTTTTCCGTTTTTCTCTTTTGCCATGATCCCGTTCTTGCTGTGGAGTAACCTTGTCCGAGGTATGTGCATGATTAGATCCATACTTAATTTGTGTGCATCACGAAGGTGAGGTTGAAATGAACTTTGCTTTTTTGACCTTTTAG 5 0 3' arm Glycine_max mirnest MIR159 0.0000005 gma-MIR159a 3e-66 -42.7 ....(((.(((..((((((((.(((((.(((((.((((((..((((((..(((((((.((.....))....)).)))))..))))))..)))))).))))).))))).))))))))...))).))).. (-42.7)