mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCAGCACATAAATACTGGAG CCAGTATTGCTGTTCTGCTGTA GAATGTACTAAAGCAGCACATAAATACTGGAGGTGATTGTGGTGTTATCCAGTATTGCTGTTCTGCTGTAGTAAGACC 5 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-16 1e-36 100 -26.9 .....(((((.(((((.(((..(((((((((..((((......)))))))))))))..))).))))).)))))..... (-26.90)