mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCTT GGGATGTTGGCTGGCTCGGTG GAGACAAGCAGTGGTTTGTGAGGGATGTTGGCTGGCTCGGTGCAATCACCTTTTCTTACCATTTCGTATAAAAGGGTGATGGCATCGGACCAGGCTTCATTCCTTTCAAACCCTTTTGTGATT TGTGTATATATATACAGCTAGCTCATGTTTGCCATTAGGGTTTATAGAAAGAAAGAAGAGAGGAAGGCCACGTATATATGGAAGATATAAAGAGACAAGCAGTGGTTTGTGAGGGATGTTGGCTGGCTCGGTGCAATCACCTTTTCTTACCATTTCGTATAAAAGGGTGATGGCATCGGACCAGGCTTCATTCCTTTCAAACCCTTTTGTGATTATCTTTTCTTGTACATTTATTGATCATAAGAAGCCAAAGGGTGTGTTAATCCATGAATTACAAGGTATTATCATATTAACTTTCACAAAACCAAGTGTTTGATGTTACGAAGATGGTTATATAATATGTGTACGTCTGTTAATTAGGCTGCTTTTATTTTTGTGTTCAAGATCTTTGGATTTTGTGTCTCTAGGGAGAGAAAGAAAGAGATTTATTATTTGGTCATTATTAGTTTCAATCTATGGATCACATGAAAAACTATTACAAGTAC 2 2 3' arm Cichorium_intybus mirnest mir-166 0.0004 vvi-MIR166b 0.00002 -51.2 ...(((((.((.((((((.((((((((..((((((.(((((((.((((((((((..(((......)))..)))))))))).))))))).))).))).)))))))).))))))))))))).... (-51.2)