mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCGTTGGTTTAGCTCAGTGGTT TCCCTGAAAAATCAACCTTTC TGGCTTTTCCGTAGTGTCGCTGTTGCGTTGGTTTAGCTCAGTGGTTACTTCTGTGATCCCTGAAAAATCAACCTTTCATGGTCACCTCGGTGCCA 4 2 5' arm Danio_rerio mirbase Vault 2e-33 100 -32.3 .(((....(((..((((((.((..(.((((((((...((((.((((((....)))))).)))).)))))))).)..))))).)))..))).))). (-32.30)