mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTAAGACGAACAAAAAGTTTT AGCTTTTTGTTTGTGTTATGT TCTACTGACAGAGAAGCTTTTTGTTTGTGTTATGTTTATTTTCAAATGTAAGACGAACAAAAAGTTTTTCTGTTAGTAGG 1 0 3' arm Danio_rerio mirbase mir-208 3e-38 100 -43.7 .(((((((((((((((((((((((((((.((((((((......)))))))).))))))))))))))))))))))))))). (-43.70)