mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGGTCCAACCTCACATGTCC CTGTGTGAGGTTAGACCTATC GGACAATATCAGCAATGTGAGAAAGGTCCAACCTCACATGTCCTGTGAGGCTGAAGGAAGGCTGTGTGAGGTTAGACCTATCCCACACGGCCCGTATTCTTCCC 3 0 5' arm Danio_rerio mirbase 100 gga-mir-2188 0.00000002 -41.14 (((.(((((..((..((((.((.(((((.(((((((((((.(((..............))).))))))))))).))))).)).))))..))..)))))..))). (-41.14)