mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGATTGGGGTGAGTTAGGGTG CTCTGATAACCACATGATTCTTA CCTCTGATAACCACATGATTCTTAAATGTAAACCACTATCAAGTTTCTTTTTGGGGGAACAATATTGAGATTGGGGTGAGTTAGGGTGCGTTCACACCTGTGAATCGATT 5 4 3' arm Danio_rerio mirbase 100 100 -25.1 .(((((((.(((.((....((((((.(((...((.(((..(((...)))..)))))..)))...)))))).)).)))..)))))))..(((((((....))))).))... (-25.10)