mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCTATACTTCTGTCATCA CTACTTGGTAATTAAGGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATATGCATATTATATAATATATAGCAGGGAACTCATGATGAATTGTGCATCTTACTCCTTTGTGCTCTCTATACTTCTGTCATCACCTTCAGCCTCCATTTC ACGAGATTCTTCTCTGCTATTTTATCCCTCCTTTGATGATTATCATCCCTTTCGTATCTCTATGTTTAGGGGGAGGTAACAGTGCATGGGGTGTAGAAGAATAGGGGAAAAGATGAGAAGGAGGCACTGCTACTTGGTAATTAAGGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATATGCATATTATATAATATATAGCAGGGAACTCATGATGAATTGTGCATCTTACTCCTTTGTGCTCTCTATACTTCTGTCATCACCTTCAGCCTCCATTTCTCACTATTCCCCCTCTACACCAACTGTTAGCTAGTGTAGTATATACTTCGTTTCTATCTACTGGAACTATAATTCATATATAAATTACTTTAATAAGCCTGTTCATATATAATAATTTGATGTTCACCCTGGGTATNTAT 1 1 5' arm Glycine_max mirnest 100 gma-MIR156d 3e-82 -47.4 .....(((.....(((((...(((((((((((((((((((((((.(((((.(((((((...(((..........((....))....)))...))))))).))).)).)))))))))))))).)))))))))..)))))......))).... (-47.4)