mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTT CAAATCACAGTCTGCCAAA CCCTGTCTGCTGCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTTTTAGTTAGATCAACTGACAACAAATCACAGTCTGCCAAACAGCACAGGC 1 2 5' arm Fugu_rubripes mirbase mir-7 1e-43 dre-mir-7b 2e-23 -40.5 ....(((((.((((((.(((.(((((.(((((((.((((((...((((.....)))))))))))))))))))))).))).))))))))))) (-40.50)