mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCAGAGCATGGATGGAGCTA GTTCTGCTCATGCACTGCCTC GAGGTAATAATAGTTAGAGACAGGACAAAGCAGGGGAACAGGCAGAGCATGGATGGAGCTATCAACACAATATTGTCAAGAAACTGAGAGTGAGAGGAGAAATATGTTGTGGTTCTGCTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCTGTCTCCATTTCTCCTTCCCTTATTT TTTTGTGCGTAATGTAGTTAATTAGACAAATTTCTAATGTGAGAATCTTTCTGAGAATGAGATGTTGCTAAATATTTCGGATGTTGTCGACAAGGATGAGGTAATAATAGTTAGAGACAGGACAAAGCAGGGGAACAGGCAGAGCATGGATGGAGCTATCAACACAATATTGTCAAGAAACTGAGAGTGAGAGGAGAAATATGTTGTGGTTCTGCTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCTGTCTCCATTTCTCCTTCCCTTATTTATTTTTTGATTTATTGAGTATGATCTGTTTTCAAATGTGTTCATAGGTTCAACTTATTAAGGTACGAACATACTCTGGGCATTGAAAACTGGTTTGACTCTTGAACATATTCCGCACCACTAATCTTTCTTGTAATCCAGGCTCACGCACGATCACTATAAGGTCCCACATTCTTAGTGGCCTAATCGTTGGAAAATGCTACTTTGGCACTACTTGATGAATTGTATGGCTGGGATTTTTTTCCCTTGCTTGTAGAATCCTCTCAATTTATGTAACCATCGTGTACTCATTTACATGTCATCAAATTTTGAATGAGATGTGATATACATAGAACAATTTGTATGACCTCATTTTCTGTGTTATTTCTCTCCATCAATATCATTTTCTAAATCTCAAAATTCTCTCTTTTTTCTTAGTTGTAGAAGTTATTGTTT 2 0 5' arm Glycine_max mirnest MIR408 0.0000000002 vvi-MIR408 0.0000000006 -56.8 ((((.......((..(((((..(((((.(((.((((((.((((((.((((((.((((((((.(((((...((((.((.....(((...))).....))..))))))))))))))))).)))))).)))))).)))))).))).)))))...))))).))..)))).... (-56.8)