mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCTCAGTTCAGCAGGAACAG GTGCCTACTGAACTGGTATCAGT GGGTTGTGCCCTCCTGTGCCTACTGAACTGGTATCAGTGTCATACTGGAAAACTGGCTCAGTTCAGCAGGAACAGGAGT 3 1 3' arm Fugu_rubripes mirbase mir-24 2e-17 fru-mir-24-1 1e-39 -33.9 (((.....)))((((((.(((.(((((((((..(((((.((.....))...))))).))))))))).))).)))))).. (-33.90)