mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCTCAGTTCAGCAGGAACAG GTGCCTGCTGTGCTGATAATCAGT GGGTCAGTCTCCTGTGCCTGCTGTGCTGATAATCAGTGTGTGACGTTGGCTGGCTCAGTTCAGCAGGAACAGGGGACTGGTC 3 2 3' arm Fugu_rubripes mirbase mir-24 9e-29 tni-mir-24-2 4e-40 -46 .(..(((((((((((.(((((((.(((((...(((((...........))))).))))).))))))).)))))))))))..) (-46.00)