mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GGTCATCCTTGCAGCTTCAAT CTTTATGTTGATTTGAGAGATTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTGATGCCAAACTGGGTGGCCTGTGTATGTTTGTCCATATATGAGTGGATAATGTAAAAGTTCTATATATAGTCAAATGTCTTTGTGTGTGTTTTTGGTGATGTGTTGGTATCTGTTCATGGGTAGAGTAAGGAGAGGTTAACCAGGTCATCCTTGCAGCTTCAATCACTCATGCCCAACAATT AGAGAGAGATATGAATAAGTCAACTTTGAATAGCTGGAAGAAAGGCACAAATCCTCACTGCTGTTGAGATCTCGCTCTATATATGATGATACTGTTACAGAGGGAGAACATGCAAACCTTTTCTATCTTTCATTTCCTCCCTTCTATCTTTACTCGGGTTTGAAGTCTCAAATCATTTTCGAGCCAAACAAAGAACAACTTTTAAGCAAATGTTTGAATCTTGGTGCACCATGGTGTCCGCCTGTCTTGTTCATGGAGTACTTTTCTTTATGTTGATTTGAGAGATTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTGATGCCAAACTGGGTGGCCTGTGTATGTTTGTCCATATATGAGTGGATAATGTAAAAGTTCTATATATAGTCAAATGTCTTTGTGTGTGTTTTTGGTGATGTGTTGGTATCTGTTCATGGGTAGAGTAAGGAGAGGTTAACCAGGTCATCCTTGCAGCTTCAATCACTCATGCCCAACAATTTTTCGTACAAAGCAAATATGAAGAAAATCCTTCAAGACTGTTTTCGCTTCAAGTTCTTGTTAATTAGCAACGGCGGATCCATGTGAAATTACTAATCCACCCAAGTAAGTACTACTTGATTGTTCATAATTCGTTGGTTGTCTCTTTTGCTTTTTTCCCCCTCTGTCATTGTTTAATTTTCTTATTGATTTCCTCAACTAACTTCTTTTATTTCATCTTAGATTTATTTATTAACTTGGAATTAATAATTAGGTTCTAATCATTTCTTTTAACTTTAGTTTCGTTGGAGACTCTTGCTTTTTGGTCTAG 2 0 5' arm Cichorium_intybus mirnest MIR167_1 0.0000000002 csi-MIR167c 0.00000000001 -64.6 .....(((((...((((.((((((((((((.((.((((((((((...(((...((.....(((((((.((..((((((((......))))))))..((((((...(((((((((..........)))))))))))))))..((((......)))).)).)))))))......))....)))..)))))))))).)).)))))))))))).))))....)))))... (-64.6)