mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTAACAGCAACTCCATGTGG AGTGGAAGTGCTGTTACCTG CGCTGGATGTAACAGCAACTCCATGTGGAAGCTGTATGTGAGTTCCAGTGGAAGTGCTGTTACCTGCAGAGA 3 1 5' arm Fugu_rubripes mirbase mir-194 3e-34 tni-mir-194 5e-33 -30.3 ..(((.(.(((((((((..(((((.(((((.((.......))))))))))))..))))))))).).)))... (-30.30)