mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGTAGTTTCATGTTGTTGGG CTGCAACATGAAACTGTCTTAA TCGAGTGGTTTAGGTAGTTTCATGTTGTTGGGGTCCATTTCAAACTCTGCAACATGAAACTGTCTTAATTGCCCCA 4 0 5' arm Fugu_rubripes mirbase mir-196 2e-29 tni-mir-196a-2 8e-38 -29.4 ....(..(((.((..(((((((((((((.(((............))).)))))))))))))..)).)))..).... (-29.40)