mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCAGTGTTCAGACTACCTGTTC TGTACAGTAGTCTGCACATTGGTTA TCCTGCTCCGTCATCCCAGTGTTCAGACTACCTGTTCAGGATTTTACTGGTGTACAGTAGTCTGCACATTGGTTAGACAGTGCATGG 2 4 5' arm Fugu_rubripes mirbase mir-199 5e-43 dre-mir-199-1 4e-37 -35.3 .(((((.(.(((...(((((((.((((((((.(((((((.......))))...))))))))))).)))))))...))).).))).)) (-35.30)