mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCAGTGTTCAGACTACCTGTTC ACAGTAGTCTGCACATTGGTTA CCGCCTGCCCAGTGTTCAGACTACCTGTTCAGGAAGTAGTGGTTGTACAGTAGTCTGCACATTGGTTAGGCTG 3 1 5' arm Fugu_rubripes mirbase mir-199 8e-35 tni-mir-199-2 5e-36 -33.2 ..(((((.(((((((.((((((((.(((.(((..........))).))))))))))).))))))).))))).. (-33.20)