mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCAGTGTTCAGACTACCTGTTC ACAGTAGTCTGCACATTGGTTA CTCCCCGTCCTGCCTGCCCAGTGTTCAGACTACCTGTTCATCAGACTAAAGCTGAACAGTAGTCTGCACATTGGTTAAGCTGGGTTGGGACACACACGC 2 1 5' arm Fugu_rubripes mirbase mir-199 9e-48 tni-mir-199-3 7e-36 -42.8 .((((..(((.((.((.(((((((.((((((((.((((((.(........).)))))))))))))).))))))).)).)).)))..))))......... (-42.80)